O Hospital São Rafael é o complexo médico-hospitalar, para qual o prof. Sac.Luigi Maria Verzé escolheu o termo de origem hebraica (Rafael) e que significa Medicina de Deus ou Deus que cura. A sua missão, de fato, é a cura do homem integral, na sua tríplice dimensão biopsicoespiritual, segundo o mandamento evangélico  Ide, Ensinai e Curai.

O São Rafael conta com uma estrutura que atende cerca de dois mil pacientes por dia. Possui 298 leitos e um centro ambulatorial com 77 consultórios médicos, serviço de emergência, hemodiálise, bioimagem, (com aparelhos de ultima geração), centro cirúrgico, anatomia patológica, laboratório de analises clinicas e toxologia, hospital dia e banco de sangue totalmente informatizado conta também com 42 leitos de terapia intensiva (geral e pediátrica) e 28 leitos de terapia semi-intensiva, que possibilitam a assistência segura e qualificada à pacientes críticos.

O HSR foi o primeiro hospital brasileiro a oferecer terapias como a litotripsia extracorpórea e um dos primeiros a instalar equipamentos de alta tecnologia, como acelerador linear, ressonância magnética e tomógrafo computadorizado. No Nordeste, foi o primeiro a adquirir o PET/CT, para o diagnóstico precoce do câncer. Atua nas mais diferentes áreas da Medicina, com corpo médico especializado, o que facilita a interdisciplinaridade e o atendimento integral de cada paciente.

Recentemente foi inaugurado o Centro de Biotecnologia e Terapia Celular (CBTC) do HSR, que tem como objetivo de aumentar as pesquisas básicas e aplicadas na área médica e biomédica, visando ao desenvolvimento de novos protocolos terapêuticos, com enfoque especial na utilização de terapia celular para o tratamento de doenças degenerativas e traumáticas, tais como cardiopatias, lesões crônicas do fígado e trauma raquimedular.